Fauna Asiatis memiliki karakteristik hewan mamalia yang berbulu lebat dan berukuran besar, terdapat berbagai jenis kera dan ikan air tawar, dan mirip dengan fauna asiatis. Wilayah persebarannya mencakup Pulau Sumatera, Jawa, Bali, dan Kalimantan. Contohnya, orang utan, kerbau, dan tapir.
Fauna Peralihan memiliki karakteristik hewan tidak berbuludatau berbuu tipid, memiiki banyak reptil besar dan merupakan fauna endemik di Indonesia. Wilayah persebarannya mencakup Sulawesi, Nusa Tenggara, Timor, dan Kepulauan Maluku. Contohnya, anoa, babi rusa, kuskus, monyet hitam, beruang, dan tarsius.
Fauna Australis memiliki karakteristik mamalia berukuran kecil, terdapat binatang berkantong, terdapat banyak burung dengan bulu warna-warni dan memiliki kesamaan dengan fauna di Australia. Wilayah persebarannya meliputi papua dan Maluku. Contohnya, kanguru, walabi, beruang nokdiak (landak papua), dan posum layang (pemanjat berkantung).