Target yang digunakan oleh Rutherford sangat tipis. Apa keuntungan dari target tipis terhadap target tebal dalam eksperimen ini?

target dibuat tipis karena partikel alfa memiliki energi yang besar dan mampu menembus lapisan tipis. Keuntungan lapisan tipis adalah dengan menggunakan lempeng tipis, penyimpangan terkecil partikel akan dapat teramati.

Berkas partikel alfa banyak dipancarkan oleh unsur polonium dan bismut, biasanya energi berkas ini sangat besar sekali, sehingga mampu menembus lapisan logam tipis atau lapisan kaca tipis. Sehingga jika model atom Thomson benar, ketika partikel alfa ditembakkan ke lempeng emas tipis, partikel itu akan bergerak lurus menembus lempeng emas tersebut. Seandainya tersimpangkan, partikel inipun akan tersimpangkan sedikit saja. Alasannya adalah karena partikel alfa itu bermassa besar (sekitar 7.500 kali massa elektron) sehingga ketika partikel ini bergerak, elektron dan awan positif tidak mampu menahan gerakan partikel tersebut. 

Dengan demikian, target dibuat tipis karena partikel alfa memiliki energi yang besar dan mampu menembus lapisan tipis. Keuntungan lapisan tipis adalah dengan menggunakan lempeng tipis, penyimpangan terkecil partikel akan dapat teramati.