Spesies endemik merupakan spesies asli yang hanya dapat ditemukan di suatu wilayah tertentu. Suatu spesies dikatakan endemik jika spesies tersebut merupakan spesies asli yang mendiami suatu wilayah tertentu yang hanya ditemukan di tempat tersebut. Di Indonesia, banyak terdapat hewan dan tumbuhan endemik. Hewan dan tumbuhan endemik Indonesia artinya hewan dan tumbuhan tersebut hanya ada di Indonesia atau tidak terdapat di negara lain.
• Hewan endemik Indonesia, misalnya harimau jawa (Panthera tigris sondaica), jalak bali putih (Leucopsar rothschildi), badak bercula satu (Rhinoceros sondaicus), binturong (Arctictis binturong), tarsius (Tarsius bancanus), kukang (Nycticebus coucang), dan komodo (Varanus komodoensis).
• Tumbuhan endemik Indonesia terutama berasal dari genus Rafflesia, misalnya Rafflesia arnoldi (endemik di Sumatra Barat, Bengkulu, dan Aceh), Rafflesia borneensis (Kalimantan), Rafflesia cilliata (Kalimantan Timur), Rafflesia horsfilldi (Jawa), Rafflesia patma (Nusa Kambangan dan Pengandaran), Rafflesia rochusseni (Jawa Barat), dan Rafflesia contleyi (Sumatra bagian timur).