Terdapat sejumlah perdebatan tentang apakah peningkatan ekspresi suatu gen akan selalu sejalan dengan codon usage bias (jenis kodon yang lebih sering digunakan oleh suatu organisme untuk mengkode suatu asam amino tertentu dari berbagai variasi kodon yang mungkin) yang dimililiki oleh gen tersebut, atau terdapat faktor lain dari komposisi nukleotida penyusun gen yang juga berperan signifikan dalam mempengaruhi ekspresinya. Peneliti telah lama curiga tentang pentingnya daerah N-terminal dari suatu gen dalam mempengaruhi level ekspresi. Pada berbagai pengamatan yang berbeda hal ini sering dikaitkan dengan adanya kehadiran urutan yang lestari (conserved), penggunaan kodonkodon langka, atau kecenderungan pembentukan struktur sekunder di daerah N-terminal tersebut. Sebuah eksperimen dilakukan dengan memvariasikan 10 kodon awal dari suatu Green Fluorescence Protein menggunakan metode codon wobble mutation (kodon dimana basa ketiga tidak selalu mengikuti aturan Watson-Crick) dan mengamati perubahan level ekspresi gen berdasarkan sejumlah parameter terkait variasi komposisi basa tersebut. Metode codon wobble mutation dilakukan untuk menghindari kemungkinan perubahan struktur primer dari protein GFP yang dapat mempengaruhi level ekspresi gennya Manakah di antara kriteria di bawah ini yang tidak digunakan untuk penentuan codon usage bias dari suatu organisme? A. Jenis kodon yang digunakan oleh highly expressed genes B. kodon-kodon lestari yang ditemukan di daerah promotor gen C. tRNA copy number dari suatu kodon D. persentase penggunaan suatu kodon dari genom organisme E. jenis kodon yang digunakan oleh gen-gen protein ribosom

Question

Jawabannya adalah B.

Bias kodon mencerminkan keseimbangan antara bias mutasi dan seleksi alam. Penggunaan kodon bias penting dalam biologi molekuler, genetika dan evolusi genom. Faktor yang mempengaruhi penggunaan codon bias yaitu ekspresi gen dimana banyak ekspresi gen yang tinggi menyebabkan bias yang tinggi. Selain itu, tingkat ekspresi, panjang gen,stabilitas RNA, hidrofobik, dan hidrofilisitas juga memengaruhi penggunaan bias kodon. Tingginya ekspresi gen, penggunaan kodon bias disebabkan oleh seleksi translasi dan tingginya ekspresi gen, kodon favorit mudah dikenali oleh tRNA yang melimpah.

Dengan demikian, jawaban yang benar adalah B.

Mau pemahaman lebih dalam untuk soal ini?

Pertanyaan serupa