Pada proses pemisahan DNA berdasarkan panjang basa menggunakan metode elektroforesis. Ketika elektroforesis sudah selesai dijalankan, dan untuk mengamati molekul DNA sehingga terlihat beberapa pita DNA, maka matriks gel agarose yang sudah mengandung DNA harus diwarnai terlebih dahulu oleh suatu senyawa yang bekerja dengan cara interkalasi pada DNA dan mampu terlihat apabila dilihat di bawah sinar UV. Senyawa kimia apakah yang digunakan? a. SYBR Green I b. Xylene cyanol c. Bromphenol Blue d. Etidium bromide e. Orange G

Jawaban yang benar adalah D. Etidium bromide Etidium bromide atau disingkat dengan EtBr merupakan suatu agen interkalasi yang digunakan sebagai pewarna. Pewarna ini mengandung fluoresen sehingga dapat digunakan untuk mewarnai asam nukleat (DNA maupun RNA). EtBr disebut sebagai agen interkalasi karena sistem kerjanya menyisip diantara basa nukleotida dan setelah itu mengikat basa-basa nukleotida tersebut, sehingga nantinya saat diiluminasi dengan UV, maka fluoresen yang terkandung dalam EtBr akan berpendar. Warna fluoresen yang muncul adalah merah atau orange. EtBr memiliki nilai absorbansi UV maksimal pada 300 – 360nm dan nilai emisi maksimal pada 590nm. Batas deteksi EtBr ke ikatan DNA sebesar 0,5 - 5,0ng/ untai. Jadi, senyawa kimia apakah yang digunakan adalah Etidium bromide (D).