BJ. Habibie merupakan presiden ke-3 yang masa jabatannya tersingkat, hanya 1 tahun 5 bulan. Masa pemerintahan yang singkat ini, ternyata banyak keberhasilan yang dicapai antara lain merekonstruksi perekonomian Indonesia, kebebasan menyalurkan aspirasi, kebebasan pers, melakukan reformasi hukum, dan melaksanakan pemilu 1999. Namun sisi lain juga terdapat kegagalan-kegagalan seperti masalah pelanggaran HAM, Semanggi I dan II, status hukum mantan Presiden Suharto dan lepasnya Timor Timur. Faktor kegagalan berdampak negatif bagi karir politik BJ. Habibie yaitu..

Faktor kegagalan tersebut berdampak pada ditolaknya Laporan Pertanggungjawaban B.J. Habibie dan mundurnya B.J. dari pencalonan presiden saat itu. Untuk lebih jelasnya, simak penjelasan berikut. Pada 14 Oktober 1999, Presiden B.J. Habibie menyampaikan pidato pertanggung jawabannya di depan Sidang Umum MPR. Dalam pemandangan umum fraksi-fraksi atas pidato pertanggungjawaban Presiden Habibie tanggal 15–16 Oktober 1999, dari 12 fraksi yang menyampaikan pemandangan umumnya, hanya empat fraksi yang secara tegas menolak, sedangkan enam fraksi lainnya masih belum menentukan putusannya. Kebanyakan fraksi itu memberikan catatan serta pertanyaan balik atas pertanggung jawaban Habibie itu. Pada umumnya masalah yang dipersoalkan adalah masalah Timor-Timur, pemberantasan KKN, masalah ekonomi dan masalah Hak Asasi Manusia. MPR dalam sidangnya tanggal 20 Oktober 1999, menolak pertanggungjawaban Presiden Habibie melalui proses voting. Pada kesempatan itu, Habibie juga menyatakan mengundurkan diri dari pencalonan presiden periode berikutnya. Dengan demikian, faktor kegagalan tersebut berdampak pada ditolaknya Laporan Pertanggungjawaban B.J. Habibie dan mundurnya B.J. dari pencalonan presiden saat itu. Semoga membantu.